GDP形成コハク酸CoAリガーゼ (Succinate—CoA ligase) は合成酵素の一種。 スクシニルCoAシンターゼ、コハク酸チオキナーゼ、スクシニルCoA合成酵素、サクシニルCoA合成酵素とも言う。シンターゼ、リガーゼというのは合成酵素を指す。EC番号はEC6.2.1.4。
| succinate-CoA ligase (GDP-forming) | |
|---|---|
| Pig GTP-specific succinyl-CoA synthetase with GTP. PDB2fp4[1] | |
| 識別子 | |
| EC番号 | 6.2.1.4 |
| CAS登録番号 | 9014-36-2 |
| データベース | |
| IntEnz | IntEnz view |
| BRENDA | BRENDA entry |
| ExPASy | NiceZyme view |
| KEGG | KEGG entry |
| MetaCyc | metabolic pathway |
| PRIAM | profile |
| PDB構造 | RCSB PDB PDBj PDBe PDBsum |
| 遺伝子オントロジー | AmiGO / (QuickGO) |
酵素学では、EC 6.2.1.4 は化学反応を触媒する酵素。
- GTP +コハク酸+ CoA GDP +リン酸+サクシニル-CoA
この酵素の3つの基質はGTP、コハク酸、およびCoAだが、その3つの産物はGDP、リン酸、およびスクシニル-CoAである。
この酵素はリガーゼファミリー 、特に酸チオールリガーゼとして炭素硫黄結合を形成するリガーゼファミリーに属している。この酵素クラスの体系的な名前は、コハク酸塩：CoAリガーゼ（GDP形成）である。一般的に使用される他の名前には、スクシニルCoAシンテターゼ（GDP形成）、スクシニルコエンザイムAシンテターゼ（グアノシン二リン酸形成）、コハク酸チオキナーゼ、コハク 酸チオキナーゼ、コハク酸 コエンザイムAシンテターゼ、コハク酸リン酸化酵素、P-酵素、SCS、G -STK、サクシニルコエンザイムAシンテターゼ（GDP形成）、サクシニルCoAシンテターゼおよびサクシニルコエンザイムAシンテターゼ。この酵素はクエン酸回路とプロパノエート代謝に関与している。
クエン酸回路を構成する酵素の一つで、コハク酸、CoA、GTPからスクシニルCoA、GDP、リン酸を生成する反応と、逆にスクシニルCoAをコハク酸とCoAに分解する反応（このときGDPがGTPとなる）を触媒する。
構造研究
2007年後半の時点で、このクラスの酵素のために解決されているPDBのアクセッションコードは1EUC、1EUD、2FP4、2FPG、2FPIおよび 2FPP の6つの構造である。
脚注
参考文献
- Boyer, PD.; Lardy, H.; Myrback, K., eds (1962). Group transfer syntheses coupled to ATP cleavage. The Enzymes. 6 (2nd ed.). New York: Academic Press. pp. 387-399. (ASIN) B00HXKBID8. doi:10.1021/ed040pA672. ISBN (978-1483276960). OCLC 952667727
- KAUFMAN, S.; GILVARG, C.; CORI, O.; OCHOA, S. (1953). “Enzymatic oxidation of alpha-ketoglutarate and coupled phosphorylation”. J. Biol. Chem. 203 (2): 869–888. PMID (13084656).
- MAZUMDER, R.; SANADI, DR.; RODWELL, VW. (1960). “Purification and properties of hog kidney succinic thiokinase”. J. Biol. Chem. 235: 2546–2550. PMID (13768680).
- Sanadi, D.R.; Gibson, David M.; Ayengar, Padmasini (1954). “Guanosine triphosphate, the primary product of phosphorylation coupled to the breakdown of succinyl coenzyme A”. Biochim. Biophys. Acta 14 (3): 434–6. doi:10.1016/0006-3002(54)90205-X. PMID (13181903).
外部リンク
- 栄養・生化学辞典『(コハク酸CoAリガーゼ（GDP形成）)』 - コトバンク