GRIK1

GRIK1、GluK1もしくはGluR5（glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1）は、ヒトではGRIK1遺伝子にコードされるタンパク質である^[5]。

GRIK1
PDBに登録されている構造 PDB オルソログ検索: RCSB PDBe PDBj PDBのIDコード一覧 2ZNS, 2ZNT, 2ZNU, 3FUZ, 3FV1, 3FV2, 3FVG, 3FVK, 3FVN, 3FVO, 4MF3
識別子
記号	GRIK1, EAA3, EEA3, GLR5, GLUR5, GluK1, gluR-5, glutamate ionotropic receptor kainate type subunit 1
外部ID	OMIM: 138245 MGI: 95814 HomoloGene: 68992 GeneCards: GRIK1
遺伝子の位置 (ヒト) 染色体 21番染色体 (ヒト)^[1] バンド データ無し 開始点 29,536,933 bp^[1] 終点 29,940,033 bp^[1]
遺伝子の位置 (マウス) 染色体 16番染色体 (マウス)^[2] バンド データ無し 開始点 87,692,788 bp^[2] 終点 88,087,153 bp^[2]
RNA発現パターン さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー 分子機能 • イオンチャネル活性 • kainate selective glutamate receptor activity • extracellularly glutamate-gated ion channel activity • ionotropic glutamate receptor activity • ligand-gated ion channel activity • シグナル伝達受容体活性 • glutamate receptor activity • transmitter-gated ion channel activity involved in regulation of postsynaptic membrane potential 細胞の構成要素 • integral component of membrane • 細胞結合 • 細胞膜 • postsynaptic membrane • integral component of plasma membrane • シナプス • 膜 • kainate selective glutamate receptor complex • presynaptic membrane 生物学的プロセス • glutamate receptor signaling pathway • 中枢神経系発生 • イオン経膜輸送 • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • イオン輸送 • 神経系発生 • 化学的シナプス伝達 • ionotropic glutamate receptor signaling pathway • 興奮性シナプス後電位 • synaptic transmission, glutamatergic • シナプス伝達の制御 • regulation of postsynaptic membrane potential 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
種	ヒト	マウス
Entrez	2897	14805
Ensembl	ENSG00000171189	ENSMUSG00000022935
UniProt	P39086	Q60934
RefSeq (mRNA)	NM_000830 NM_175611 NM_001320616 NM_001320618 NM_001320621 NM_001320630 NM_001330993 NM_001330994 NM_001393424 NM_001393425 NM_001393426	NM_010348 NM_146072 NM_001346964
RefSeq (タンパク質)	NP_000821 NP_001307545 NP_001307547 NP_001307550 NP_001307559 NP_001317922 NP_001317923 NP_783300	n/a
場所 (UCSC)	Chr 21: 29.54 – 29.94 Mb	Chr 21: 87.69 – 88.09 Mb
PubMed検索	^[3]	^[4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト 閲覧/編集 マウス

機能

GRIK1遺伝子は、リガンド依存性イオンチャネルとして機能するグルタミン酸受容体のサブユニットの1つをコードする。この遺伝子にコードされるサブユニットは、カイニン酸受容体に属する。受容体の組み立てと細胞内の輸送は、RNA編集と選択的スプライシングによって調節されている。これらの受容体は興奮性神経伝達を媒介し、シナプスの正常な機能に重要である^[5]。

相互作用

GRIK1は(DLG4)（英語版）^[6]、(PICK1)（英語版）^[6]、(SDCBP)（英語版）^[6]と相互作用することが示されている。

RNA編集

GluK1をコードするpre-mRNAは、膜貫通領域M2に位置するQ/R部位の1か所が編集される。編集によって、この部位のコドンはグルタミン（Q）をコードするCAGからアルギニン（R）をコードするCGGへ変化する^[7]。GluK2と同様、編集の際に二本鎖RNAを形成する相補性配列（Editing Complementary Sequence、ECS）は編集部位から約2000ヌクレオチド下流に位置している^[8]。

このRNA編集は受容体のカルシウムイオン透過性に影響を与え、編集によって透過性が低下すると考えられている^[7]。またQ/R部位の編集は、アラキドン酸やドコサヘキサエン酸などの膜脂肪酸によるチャネルの阻害にも影響を及ぼす^[9]。編集型アイソフォームのみからなるカイニン酸受容体はこれらの脂肪酸によって強力に阻害されるが、未編集型のサブユニットが1つでも組み込まれるとこの阻害は解除される^[9]。

出典

1. ^ ^{a b c} GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000171189 - Ensembl, May 2017
2. ^ ^{a b c} GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000022935 - Ensembl, May 2017
3. ^ Human PubMed Reference:
4. ^ Mouse PubMed Reference:
5. ^ ^{a b} “Entrez Gene: GRIK1 glutamate receptor, ionotropic, kainate 1”. 2023年4月22日閲覧。
6. ^ ^{a b c} Hirbec, Hélène; Francis, Joanna C.; Lauri, Sari E.; Braithwaite, Steven P.; Coussen, Françoise; Mulle, Christophe; Dev, Kumlesh K.; Coutinho, Victoria et al. (Feb 2003). “Rapid and differential regulation of AMPA and kainate receptors at hippocampal mossy fibre synapses by PICK1 and GRIP”. Neuron (United States) 37 (4): 625–38. doi:10.1016/S0896-6273(02)01191-1. ISSN 0896-6273. PMC 3314502. PMID (12597860). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3314502/. 
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9. ^ ^{a b} “Amino Acid Substitutions in the Pore Helix of GluR6 Control Inhibition by Membrane Fatty Acids”. J. Gen. Physiol. 132 (1): 85–99. (July 2008). doi:10.1085/jgp.200810009. PMC 2442176. PMID (18562501). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2442176/. 

関連文献

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• “Expression and novel subunit isoforms of glutamate receptor genes GluR5 and GluR6”. NeuroReport 4 (12): 1343–6. (1994). doi:10.1097/00001756-199309150-00014. PMID (8260617). 
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• “Cell surface expression of GluR5 kainate receptors is regulated by an endoplasmic reticulum retention signal”. J. Biol. Chem. 278 (52): 52700–9. (2004). doi:10.1074/jbc.M309585200. PMID (14527949). 

関連項目

• カイニン酸型グルタミン酸受容体

外部リンク

• (GRIK1 protein, human) - MeSH・アメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス（英語）