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BCR (タンパク質)

BCR(breakpoint cluster region protein)は、ヒトではBCR遺伝子にコードされるタンパク質である。BCR遺伝子は、フィラデルフィア染色体と関係したBCR-ABL融合遺伝子を構成する2つの遺伝子のうちの一方である。BCR遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする2種類の転写バリアントが見つかっている。

BCR
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1K1F, 2AIN

識別子
記号BCR, Bcr, 5133400C09Rik, AI561783, AI853148, mKIAA3017, ALL, BCR1, CML, D22S11, D22S662, PHL, RhoGEF and GTPase activating protein, BCR gene, BCR activator of RhoGEF and GTPase
外部IDOMIM: 151410 MGI: 88141 HomoloGene: 3192 GeneCards: BCR
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体22番染色体 (ヒト)[1]
バンドデータ無し開始点23,179,704 bp[1]
終点23,318,037 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
染色体10番染色体 (マウス)[2]
バンドデータ無し開始点74,896,424 bp[2]
終点75,020,753 bp[2]
遺伝子オントロジー
分子機能 transferase activity
ヌクレオチド結合
guanyl-nucleotide exchange factor activity
キナーゼ活性
protein serine/threonine kinase activity
血漿タンパク結合
酵素結合
protein tyrosine kinase activity
ATP binding
GTPase activator activity
細胞の構成要素 細胞質
細胞質基質
postsynaptic membrane

シナプス後肥厚
細胞膜
シナプス
細胞結合
エキソソーム
高分子複合体
Schaffer collateral - CA1 synapse
glutamatergic synapse
postsynaptic density, intracellular component
細胞内
生物学的プロセス positive regulation of phagocytosis
intracellular signal transduction
neuromuscular process controlling balance
リン酸化
regulation of cell cycle
negative regulation of blood vessel remodeling
タンパク質リン酸化
negative regulation of cellular extravasation
リポ多糖への反応
脳発生
regulation of vascular permeability
negative regulation of cell migration
negative regulation of neutrophil degranulation
inner ear morphogenesis
自己リン酸化
platelet-derived growth factor receptor signaling pathway
regulation of Rho protein signal transduction
regulation of small GTPase mediated signal transduction
negative regulation of inflammatory response
actin cytoskeleton organization
シグナル伝達
peptidyl-tyrosine phosphorylation
renal system process
homeostasis of number of cells
regulation of nitrogen compound metabolic process
definitive hemopoiesis
negative regulation of respiratory burst
intracellular protein transmembrane transport
cellular response to lipopolysaccharide
negative regulation of reactive oxygen species metabolic process
positive regulation of GTPase activity
シナプス伝達の制御
small GTPase mediated signal transduction
keratinocyte differentiation
focal adhesion assembly
activation of GTPase activity
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_004327
NM_021574

NM_001081412

RefSeq
(タンパク質)

NP_004318
NP_067585

NP_001074881

場所
(UCSC)
Chr 22: 23.18 – 23.32 MbChr 22: 74.9 – 75.02 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス
Bcr-Abl oncoprotein oligomerisation domain
Bcr-Ablがんタンパク質のオリゴマー化ドメインの構造
識別子
略号 Bcr-Abl_Oligo
Pfam PF09036
InterPro IPR015123
利用可能な蛋白質構造:
Pfam structures
PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj
(PDBsum) structure summary
(テンプレートを表示)

機能

BCR-ABL融合タンパク質に関しては多くの研究がなされている一方で、正常なBCR遺伝子産物の機能はいまだ明確ではない。BCRタンパク質はセリン/スレオニンキナーゼ活性を持ち[5]、また(RhoA)(英語版)に対するグアニンヌクレオチド交換因子[6](Rac)(英語版)に対するGTPアーゼ活性化タンパク質として機能する[7]

臨床的意義

22番染色体(9番染色体)(英語版)との間の相互転座によって形成されるフィラデルフィア染色体は、慢性骨髄性白血病の患者にみられることが多い。この転座における22番染色体上の切断点はBCR遺伝子内に位置している。この転座によって、BCR遺伝子と9番染色体上の切断点に位置するABL遺伝子の双方に由来する配列からBCR-ABL融合タンパク質が産生されるようになる[5]

構造

 
染色体転座によるBCR-ABL融合遺伝子形成の模式図

BCR-ABLがんタンパク質のオリゴマー化ドメインはBCRのN末端に位置し、この融合タンパク質の発がん性に必要不可欠である。オリゴマー化ドメインはN末端の短いヘリックス(α1)、柔軟なループ、そしてC末端の長いヘリックス(α2)から構成される。これらはN字型構造を形成し、2つのヘリックスは平行な向きに並ぶ。2つの単量体ドメインは、α2ヘリックスの間での逆平行コイルドコイルの形成、そしてα1ヘリックス間のドメインスワッピングによって一方のα1ヘリックスがもう一方のα2ヘリックスに対してパッキングすることで二量体を形成する。その後、2つの二量体が四量体へと結合する[8]。BCR-ABLがんタンパク質の逆平行コールドコイルドメイン(BCR30-65)を開始構造とした構造ベースの改変によって、pH感受性のホモ二量体逆平行コイルドコイルが作出されている[9]

相互作用

BCRは次に挙げる因子と相互作用することが示されている。

出典

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000186716 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000009681 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ a b “Entrez Gene: Breakpoint cluster region”. 2022年8月6日閲覧。
  6. ^ Dubash AD, Koetsier JL, Amargo EV, Najor NA, Harmon RM, Green KJ (August 2013). ("The GEF Bcr activates RhoA/MAL signaling to promote keratinocyte differentiation via desmoglein-1"). The Journal of Cell Biology. 202 (4): 653–666. doi:10.1083/jcb.201304133. PMC (3747303). (PMID) (23940119)。
  7. ^ Diekmann, D.; Brill, S.; Garrett, M. D.; Totty, N.; Hsuan, J.; Monfries, C.; Hall, C.; Lim, L. et al. (1991-05-30). “Bcr encodes a GTPase-activating protein for p21rac”. Nature 351 (6325): 400–402. doi:10.1038/351400a0. ISSN 0028-0836. PMID (1903516). https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1903516. 
  8. ^ Zhao X, Ghaffari S, Lodish H, Malashkevich VN, Kim PS (February 2002). "Structure of the Bcr-Abl oncoprotein oligomerization domain". Nature Structural Biology. 9 (2): 117–120. doi:10.1038/nsb747. (PMID) (11780146). (S2CID) 17453012。
  9. ^ Nagarkar, Radhika P.; Fichman, Galit; Schneider, Joel P. (2020-08-14). “Engineering and characterization of a<scp>pH</scp>‐sensitive homodimeric antiparallel coiled coil”. Peptide Science 112 (5). doi:10.1002/pep2.24180. ISSN 2475-8817. https://doi.org/10.1002/pep2.24180. 
  10. ^ a b c Puil L, Liu J, Gish G, Mbamalu G, Bowtell D, Pelicci PG, et al. (February 1994). ("Bcr-Abl oncoproteins bind directly to activators of the Ras signalling pathway"). The EMBO Journal. 13 (4): 764–773. doi:10.1002/j.1460-2075.1994.tb06319.x. PMC (394874). (PMID) (8112292)。
  11. ^ Ling X, Ma G, Sun T, Liu J, Arlinghaus RB (January 2003). "Bcr and Abl interaction: oncogenic activation of c-Abl by sequestering Bcr". Cancer Research. 63 (2): 298–303. (PMID) (12543778)。
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関連文献

  • Wang L, Seale J, Woodcock BE, Clark RE (August 2002). "e19a2-positive chronic myeloid leukaemia with BCR exon e16-deleted transcripts". Leukemia. 16 (8): 1562–1563. doi:10.1038/sj.leu.2402600. (PMID) (12145699). (S2CID) 24651759。

関連項目

外部リンク

  • (BCR protein, human) - MeSHアメリカ国立医学図書館・生命科学用語シソーラス(英語)
  • Human BCR genome location and BCR gene details page in the UCSC Genome Browser.
  • Overview of all the structural information available in the PDB for UniProt: P11274 (Human Breakpoint cluster region protein) at the PDBe-KB.
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