5.8SリボソームRNA（英: 5.8S ribosomal RNA、5.8S rRNA）は、真核生物のリボソーム大サブユニットの構成要素となるノンコーディングRNAであり、タンパク質の翻訳に重要な役割を果たしている。5.8S rRNAは(45S) pre-rRNAの一部としてRNAポリメラーゼIによって転写される。45S pre-rRNAには他に18S rRNA、(28S rRNA)も含まれている。5.8S rRNAの機能はリボソームのトランスロケーションに関するものであると考えられている[1]。また、p53と共有結合を形成することも知られている[2]。5.8S rRNAはmiRNAの検出の際のリファレンス遺伝子としても用いられ[3]、rRNAが関与するその他の細胞内過程や経路をより良く理解するためにも利用される[4]。
| 5.8S ribosomal RNA | |
|---|---|
| 識別 | |
| 略称 | 5_8S_rRNA |
| Rfam | RF00002 |
| その他のデータ | |
| リボ核酸の種類 | 遺伝子; rRNA |
| ドメイン | 真核生物 |
| GO | 0003735 0005840 |
| SO | 0000375 |
| PDB構造 | PDBe |
5.8S rRNAは真核生物以外のリボソーム大サブユニットのrRNA（LSU rRNA）の5'末端と相同である。真核生物では、ITS2の挿入によってLSU rRNAは5.8S rRNAと28S rRNAへ分割されている[5]。一部のハエでは、5.8S rRNAはさらに2つの部分へと分割されている[6]。
構造
5.8S rRNAの長さは約150ヌクレオチドであり、大部分は折りたたまれているが、一部の領域は一本鎖構造であると推定されている[7]。5.8S rRNAは、28S rRNA、5S rRNA、そして46種類の(リボソームタンパク質)とともに、リボソームの大サブユニットを形成する[7]。5.8S rRNAはまず18S rRNA、28S rRNAとともに45S pre-rRNAとして転写される。45S pre-rRNAには他に、ITS1、ITS2（internal transcribed spacer）、5' ETS、3' ETS（external transcribed spacer）と呼ばれる領域が含まれている[8]。5.8S rRNAは2つのITS領域の間に位置しており、ITS1は5.8S rRNAの5'側に位置して18S rRNAを隔てており、ITS2は3'側に位置して28S rRNAを隔てている。ITSとETSはrRNAの成熟過程で切除される。切除はエンドヌクレアーゼとエキソヌクレアーゼの双方が関与する連続的な切断経路によって行われ、これらのスペーサー領域は特定の位置で切断される[8]。
出典
- ^ “Role of the 5.8S rRNA in ribosome translocation”. Nucleic Acids Research 25 (9): 1788–1794. (May 1997). doi:10.1093/nar/25.9.1788. PMC 146658. PMID (9108162).
- ^ “Cytoplasmic p53 polypeptide is associated with ribosomes”. Molecular and Cellular Biology 17 (6): 3146–3154. (June 1997). doi:10.1128/MCB.17.6.3146. PMC 232167. PMID (9154813).
- ^ “Facile means for quantifying microRNA expression by real-time PCR”. BioTechniques 39 (4): 519–525. (October 2005). doi:10.2144/000112010. PMID (16235564).
- ^ “The ribosomal 5.8S RNA: eukaryotic adaptation or processing variant?”. Canadian Journal of Biochemistry and Cell Biology 62 (6): 311–320. (June 1984). doi:10.1139/o84-044. PMID (6380683).
- ^ Lafontaine, D. L. J.; Tollervey, D. (2001). “The function and synthesis of ribosomes”. Nature Reviews Molecular Cell Biology 2 (7): 514–520. doi:10.1038/35080045. hdl:(1842/729). PMID (11433365).
- ^ Shimada, T. (August 1992). “Distribution of split 5.8S ribosomal RNA in Diptera”. Insect Molecular Biology 1 (1): 45–48. doi:10.1111/j.1365-2583.1993.tb00076.x. PMID (1343775).
- ^ a b “5.8S ribosomal RNA”. Cell 33 (2): 320–322. (June 1983). doi:10.1016/0092-8674(83)90413-0. PMID (6861202).
- ^ a b “An overview of pre-ribosomal RNA processing in eukaryotes”. Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA 6 (2): 225–242. (27 Oct 2014). doi:10.1002/wrna.1269. PMC 4361047. PMID (25346433).
外部リンク
- Rfam page for 5.8S ribosomal RNA
- Arabidopsis 5.8S rRNA sequence
- Rice 5.8S rRNA sequence