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第XI因子

第XI因子(だい11いんし、: factor XI)または血漿トロンボプラスチン前駆物質(plasma thromboplastin antecedent)は、血液凝固カスケードの酵素の1つ第XIa因子酵素前駆体である。他の凝固因子と同様、セリンプロテアーゼである。ヒトでは、第XI因子はF11遺伝子にコードされる[5][6][7][8]

F11
PDBに登録されている構造
PDBオルソログ検索: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧

1XX9, 1XXD, 1XXF, 1ZHM, 1ZHP, 1ZHR, 1ZJD, 1ZLR, 1ZMJ, 1ZML, 1ZMN, 1ZOM, 1ZPB, 1ZPC, 1ZPZ, 1ZRK, 1ZSJ, 1ZSK, 1ZSL, 1ZTJ, 1ZTK, 1ZTL, 2F83, 2FDA, 2J8J, 2J8L, 3BG8, 3SOR, 3SOS, 4CR5, 4CR9, 4CRA, 4CRB, 4CRC, 4CRD, 4CRE, 4CRF, 4CRG, 4NA7, 4NA8, 4TY6, 4TY7, 4WXI, 4X6M, 4X6N, 4X6O, 4X6P, 4Y8X, 4Y8Y, 4Y8Z, 4D7F, 5E2O, 5E2P, 4D76, 4D7G, 5EXL, 5I25, 5EXM, 5EOD, 5EXN, 5EOK

識別子
記号F11, FXI, coagulation factor XI, PTA, factor XI
外部IDOMIM: 264900 MGI: 99481 HomoloGene: 86654 GeneCards: F11
遺伝子の位置 (ヒト)
染色体(4番染色体 (ヒト))[1]
バンドデータ無し開始点186,266,189 bp[1]
終点186,289,681 bp[1]
遺伝子の位置 (マウス)
染色体8番染色体 (マウス)[2]
バンドデータ無し開始点45,694,211 bp[2]
終点45,715,068 bp[2]
RNA発現パターン
さらなる参照発現データ
遺伝子オントロジー
分子機能 serine-type aminopeptidase activity
ペプチダーゼ活性
heparin binding
serine-type endopeptidase activity
serine-type peptidase activity
血漿タンパク結合
加水分解酵素活性
identical protein binding
細胞の構成要素 細胞外領域
細胞膜
エキソソーム

細胞外空間
生物学的プロセス 止血
blood coagulation, intrinsic pathway
plasminogen activation
regulation of blood coagulation
タンパク質分解
positive regulation of fibrinolysis
凝固・線溶系
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
ヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)

NM_000128
NM_019559
NM_001354804

NM_028066

RefSeq
(タンパク質)

NP_000119
NP_001341733

NP_082342

場所
(UCSC)
Chr 4: 186.27 – 186.29 MbChr 4: 45.69 – 45.72 Mb
PubMed検索[3][4]
ウィキデータ
閲覧/編集 ヒト閲覧/編集 マウス

機能

第XI因子は肝臓で産生され、不活性型のホモ二量体体として循環する[9]血漿中の半減期は約52時間である。第XI因子は、第XIIa因子トロンビンによって第XIa因子へと活性化され、第XIa因子自身によっても活性化される。第XIIa因子によって活性化されるため、内因系のメンバーである[10]

第XIa因子は、第IX因子の特定のアルギニン-アラニン、アルギニン-バリン間のペプチド結合を切断し、活性化する。その結果生じた第IXa因子は第VIIIa因子と複合体を形成し、第X因子を活性化する。

第XIa因子の阻害因子には(プロテインZ依存性プロテアーゼインヒビター)(英語版)(ZPI、セルピンのメンバー)があり、その作用は(プロテインZ)(英語版)非依存的である(ZPIの第X因子への作用はプロテインZ依存的であり、名称はそれに由来する)。

構造

第XI因子は1本のポリペプチド鎖として合成されるが、ホモ二量体として血液を循環する。各鎖の分子量はおよそ80000である。第XI因子の一般的な血漿中の濃度は5 μg/mLで、二量体としておよそ30 nMに相当する。第XI因子の遺伝子の長さは23kbで、4番染色体(4q32-35)に位置し、15のエクソンを持つ[6][7]

第XI因子は4つの(Appleドメイン)(英語版)から構成され、5番目のセリンプロテアーゼドメインの下にディスク状のプラットフォームを形成する。1つ目のAppleドメインはトロンビンと(HMWK)(英語版)の結合部位を含み、3つ目のドメインは第IX因子とヘパリン(糖タンパク質Ib)(英語版)を結合する。4つ目のドメインは第XI因子のホモ二量体の形成に関与しており、ジスルフィド結合を形成するシステイン残基を含む[11]

ホモ二量体では、Appleドメインは斜めに連結された2つのディスク状のプラットフォームを形成し、触媒ドメインはそこから両側に突き出している。

トロンビンまたは第XIIa因子による活性化は、二量体の両方のサブユニットのアルギニン369-イソロイシン370間のペプチド結合の切断によって行われる。その結果、触媒ドメインはディスク状のAppleドメインから部分的に解離し、4番目のドメインとはジスルフィド結合で連結されたままであるが、3番目のドメインからは離れた位置となる。これによって3番目のAppleドメインの第IX因子結合部位が露出し、第XI因子の第IX因子に対するプロテアーゼ活性が発揮されるようになると考えられている[12]

疾患における役割

第XI因子の欠乏は、稀な疾患である血友病Cを引き起こす。この疾患は主にアシュケナジムユダヤ人にみられ、集団の約8%が影響を受けていると考えられている。頻度はより低いものの、血友病Cはイラクにルーツを持つユダヤ人やイスラエルアラブ人にもみられる。他の集団では、血友病症例の約1%が血友病Cである。常染色体劣性の遺伝疾患で、特発性出血は稀であるものの手術時に過剰な失血が生じる可能性があり、予防が必要である[13]

低レベルの第XI因子は、ヌーナン症候群など多くの他の疾患でも見られる。

高レベルの第IX因子は血栓症との関連が示唆されているが、何が因子のレベルを決定しているのか、そしてそれがどの程度重症であるのかについては不確実である。

出典

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000088926 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031645 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Amino acid sequence of human factor XI, a blood coagulation factor with four tandem repeats that are highly homologous with plasma prekallikrein”. Biochemistry 25 (9): 2417–24. (May 1986). doi:10.1021/bi00357a018. PMID (3636155). 
  6. ^ a b “Organization of the gene for human factor XI”. Biochemistry 26 (23): 7221–8. (Nov 1987). doi:10.1021/bi00397a004. PMID (2827746). 
  7. ^ a b “Factor XI gene (F11) is located on the distal end of the long arm of human chromosome 4”. Cytogenetics and Cell Genetics 52 (1-2): 77–8. (1989). doi:10.1159/000132844. PMID (2612218). 
  8. ^ “A detailed multipoint map of human chromosome 4 provides evidence for linkage heterogeneity and position-specific recombination rates”. American Journal of Human Genetics 48 (5): 911–25. (May 1991). PMC 1683054. PMID (1673289). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1683054/. 
  9. ^ “Factor XI homodimer structure is essential for normal proteolytic activation by factor XIIa, thrombin, and factor XIa”. The Journal of Biological Chemistry 283 (27): 18655–64. (Jul 2008). doi:10.1074/jbc.M802275200. PMC 2441546. PMID (18441012). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2441546/. 
  10. ^ Walsh, P. N. (2001-07). “Roles of platelets and factor XI in the initiation of blood coagulation by thrombin”. Thrombosis and Haemostasis 86 (1): 75–82. ISSN 0340-6245. PMID (11487044). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11487044. 
  11. ^ Minnema, Monique C.; Meijers, Joost C. M. (2013) (英語). Factor XI, TAFI and DIC. Landes Bioscience. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK6496/ 
  12. ^ “Structure and function of factor XI”. Blood 115 (13): 2569–77. (Apr 2010). doi:10.1182/blood-2009-09-199182. PMC 4828079. PMID (20110423). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4828079/. 
  13. ^ “Factor XI deficiency”. Baillière's Clinical Haematology 9 (2): 355–68. (Jun 1996). doi:10.1016/S0950-3536(96)80068-0. PMID (8800510). 

関連文献

  • “Do platelets synthesize factor XI?”. Journal of Thrombosis and Haemostasis 2 (10): 1709–12. (2005). doi:10.1111/j.1538-7836.2004.00935.x. PMID (15456479). 
  • “Coagulation factor XI: a database of mutations and polymorphisms associated with factor XI deficiency”. Blood Coagulation & Fibrinolysis : An International Journal in Haemostasis and Thrombosis 16 (4): 231–8. (Jun 2005). doi:10.1097/01.mbc.0000169214.62560.a5. PMID (15870541). 
  • “Factor XI in haemostasis and thrombosis: past, present and future”. Thrombosis and Haemostasis 98 (1): 84–9. (Jul 2007). doi:10.1160/th07-04-0246. PMID (17597996). 
  • “Expression of human blood coagulation factor XI: characterization of the defect in factor XI type III deficiency”. Blood 79 (6): 1435–40. (Mar 1992). PMID (1547342). 
  • “Factor XI activation in a revised model of blood coagulation”. Science 253 (5022): 909–12. (Aug 1991). doi:10.1126/science.1652157. PMID (1652157). 
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  • “Location of the disulfide bonds in human coagulation factor XI: the presence of tandem apple domains”. Biochemistry 30 (8): 2056–60. (Feb 1991). doi:10.1021/bi00222a008. PMID (1998667). 
  • “Activation of human blood coagulation factor XI independent of factor XII. Factor XI is activated by thrombin and factor XIa in the presence of negatively charged surfaces”. The Journal of Biological Chemistry 266 (12): 7353–8. (Apr 1991). PMID (2019570). 
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  • “Stoichiometry of binding of high molecular weight kininogen to factor XI/XIa”. Biochemical and Biophysical Research Communications 133 (2): 417–22. (1986). doi:10.1016/0006-291X(85)90922-2. PMID (3936495). 
  • “Immunologic studies of human coagulation factor XI and its complex with high molecular weight kininogen”. Blood 62 (5): 1123–31. (Nov 1983). PMID (6626744). 
  • “Factor XI antigen and activity in human platelets”. Blood 59 (6): 1148–56. (Jun 1982). PMID (7044446). 
  • “Identification of two novel mutations in non-Jewish factor XI deficiency”. British Journal of Haematology 90 (4): 916–20. (Aug 1995). doi:10.1111/j.1365-2141.1995.tb05215.x. PMID (7669672). 
  • “Six point mutations that cause factor XI deficiency”. Blood 85 (6): 1509–16. (Mar 1995). PMID (7888672). 
  • “Dimer dissociation and unfolding mechanism of coagulation factor XI apple 4 domain: spectroscopic and mutational analysis”. Journal of Molecular Biology 367 (2): 558–73. (Mar 2007). doi:10.1016/j.jmb.2006.12.066. PMC 1945241. PMID (17257616). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1945241/. 
  • “Solution structure of the A4 domain of factor XI sheds light on the mechanism of zymogen activation”. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 104 (40): 15693–8. (Oct 2007). doi:10.1073/pnas.0703080104. PMC 1987390. PMID (17884987). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1987390/. 

外部リンク

  • ペプチダーゼとその阻害因子に関する(MEROPS)オンラインデータベース: S01.213
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