本稿には、2013年現在佐世保市が運営する市立中学校の基本データ一覧を挙げる。生徒数・学級数は2013年度の長崎県教育庁発表データに基づく
佐世保市立宮中学校（みやちゅうがっこう）
佐世保市立三川内中学校（みかわちちゅうがっこう）
- 所在地：新行江町957（西肥バス「三川内支所前」バス停から10分）
- 生徒数92名、3学級
- 校区：三川内小学校区。
- 昭和22年（1947年）、折尾瀬小学校に間借りして「折尾瀬村立折尾瀬中学校」設立、佐世保市編入に合わせ「三川内中学校」に改称。
- 校歌：「西岳遠く雲は湧き…」作詞・田原南軒/作曲・富永定美
佐世保市立広田中学校（ひろだちゅうがっこう）
- 所在地：重尾町188（西肥バス「広田中学校前」バス停すぐ）
- 生徒数465名、14学級（特別支援教室1を含む）
- 校区：広田小学校区。
- 平成3年（1991年）、早岐中学校区の生徒増加緩和のため、現在地に「佐世保市立広田中学校」分離設立。
- 校歌：「恵み豊かなふるさとの…」作詞・本間真一/作曲・小川源
設立時、校歌はアカペラであった。
佐世保市立早岐中学校（はいきちゅうがっこう）
佐世保市立東明中学校（とうめいちゅうがっこう）
佐世保市立日宇中学校（ひうちゅうがっこう）
- 所在地：日宇町218（西肥バス「日宇駅前」バス停から15分）
- 生徒数734名、22学級（特別支援教室2を含む）
- 校区：日宇小学校区・黒髪小学校区・大塔小学校区。
- 昭和22年（1947年）、旧日宇小学校跡に「佐世保市立日宇中学校」設立。昭和52年の全焼火災を機に現在地へ移転。
- 校歌：「風にそよぐよ美しきもの…」作詞・浜野重郎/作曲・早川清一
部活動面では、バレー部が、県大会3連覇、全国大会出場2回、2005年に全国3位、翌年、2位という輝かしい成績をもっている
佐世保市立福石中学校（ふくいしちゅうがっこう）
佐世保市立崎辺中学校（さきべちゅうがっこう）
佐世保市立山澄中学校（やまずみちゅうがっこう）
佐世保市立祇園中学校（ぎおんちゅうがっこう）
- 所在地（平成25年度以降）：祇園町14-12（西肥バス「島瀬町」バス停から15分）・仮校舎（平成23年度～平成24年度）：花園町10-1（西肥バス「花園町」バス停すぐ）
- 生徒数421名、14学級（特別支援教室2を含む）
- 校区：小佐世保小学校区・祇園小学校区・山手小学校区
- 平成23年（2011年）旭中学校と花園中学校を統合し、「祇園中学校」設立。
旧旭中施設を取り壊し、平成25年（2013年）新校舎完成。
- 完成までの間、仮校舎として、平成23年（2011年）4月から平成25年（2013年）3月まで旧花園中施設を使用していた。
- 校歌：「朝日に映える烏帽子岳…」作詞・新谷智恵子/作曲・松岡貴史
佐世保市立清水中学校（しみずちゅうがっこう）
佐世保市立光海中学校（こうかいちゅうがっこう）
- 所在地：金比良町1-15（西肥バス「光海中学校前」バス停すぐ）
- 生徒数70名、3学級
- 校区：金比良小学校区。
- 昭和23年（1948年）、現在地（佐世保工廠分工場跡）に「佐世保市立光海中学校」設立。
- 校歌：「新しき世紀の夜明け…」作詞・堀江一郎/作曲・池田市郎
佐世保市立愛宕中学校（あたごちゅうがっこう）
佐世保市立日野中学校（ひのちゅうがっこう）
佐世保市立相浦中学校（あいのうらちゅうがっこう）
佐世保市立浅子中学校（あさごちゅうがっこう）
佐世保市立黒島中学校（くろしまちゅうがっこう）
佐世保市立中里中学校（なかざとちゅうがっこう）
佐世保市立大野中学校（おおのちゅうがっこう）
佐世保市立柚木中学校（ゆのきちゅうがっこう）
- 所在地：柚木町2063（西肥バス「柚木小学校前」バス停から5分）
- 生徒数88名、3学級
- 校区：柚木小学校区。
- 昭和22年（1947年）、柚木小学校に間借りして「柚木村立柚木中学校」設立。
- 校歌：「紅葉映ゆる国見岳…」作詞・近藤益雄/作曲・伊藤英一
- 第13回全国中学生空手道選手権大会 男子団体戦準優勝
佐世保市立吉井中学校（よしいちゅうがっこう）
佐世保市立世知原中学校（せちばるちゅうがっこう）
- 所在地：世知原町栗迎132-1（西肥バス「大正町」バス停から2分）。
- 生徒数101名、4学級。
- 校区：世知原小学校区。
- 昭和22年（1947年）、「世知原村立世知原中学校」として設立。
- 昭和41年度永年保健体育指導研究発表表彰状を受ける。
- 平成17年佐世保市との合併により,佐世保市立世知原中学校となる。
- 校歌：「胸をはり 天を仰げば…」作詞・岸川勝己/作曲・毛利研磨。
- 施設内容:床面積 3,042平方メートル、敷地面積 3,382平方メートル、運動場面積 8,143平方メートル
佐世保市立小佐々中学校（こさざちゅうがっこう）
佐世保市立宇久中学校（うくちゅうがっこう）
佐世保市立江迎中学校（えむかえちゅうがっこう）
佐世保市立鹿町中学校（しかまちちゅうがっこう）
かつて存在した公立中学校
- 江上中学校（えがみちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）、旧海軍施設部跡地に「江上村立江上中学校」設立。昭和42年（1967年）針尾中学校と対等合併、東明中学校が成立し閉校。
- 針尾中学校（はりおちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）、旧海軍送信所跡に「崎針尾村立崎針尾中学校」設立、佐世保編入に合わせ「針尾中学校」に改称。昭和42年（1967年）江上中学校と対等合併、東明中学校が成立し閉校。
- 楠栖中学校（くすずみちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）「小佐々村立楠栖中学校」設立。北松炭田の閉山にともない、昭和44年（1969年）小佐々中学校に編入。
- 神浦中学校（こうのうらちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）「神浦村立神浦中学校」設立。宇久島の過疎化にともない、平成18年（2006年）宇久中学校に編入。
- 猪調中学校（いのつきちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）「江迎町立猪調中学校」設立。校舎全焼を期に昭和39年（1964年）江迎中学校に編入。
- 歌浦中学校（うたがうらちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）「鹿町村立歌浦中学校」設立。鹿町炭田閉山により、昭和47年（1972年）鹿町中学校と対等合併。
- 旭中学校（あさひちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）小佐世保小学校に間借りして「佐世保市立旭中学校」設立。昭和24年(1947)現在地に移転。平成23年（2011年）花園中学校と合併し祇園中学校成立。
- 花園中学校（はなぞのちゅうがっこう）…昭和32年（1957年）旭中学校区生徒増加緩和のため、米軍乗馬クラブ跡に「佐世保市立花園中学校」分離独立。平成23年（2011年）旭中学校と合併し祇園中学校成立。
- 野崎中学校（のざきちゅうがっこう）…昭和22年（1947年）俵浦小学校に間借りして「佐世保市立俵浦中学校」設立。昭和47年に「佐世保市立野崎中学校」に改称。平成28年（2016年）愛宕中学校に統合。