慈眼院（じげんいん）は、以下の寺院や人物などの院号。
日本の仏教寺院
- 慈眼院 - 大阪府泉佐野市にある真言宗寺院。境内は国史跡、多宝塔は国宝。
- 慈眼院 (高崎市) - 群馬県高崎市にある真言宗の寺院。境内に高崎白衣大観音（高崎観音）がある。東国花の寺百ヶ寺 群馬7番札所。
- 慈眼院 (文京区) - 東京都文京区にある浄土宗の寺院。
- 慈眼院 (葛飾区) - 東京都葛飾区にある寺院。
- (慈眼院 (静岡県河津町)) - 静岡県河津町にある曹洞宗の寺院。
- (慈眼院 (名古屋市)) - 愛知県名古屋市にある曹洞宗の寺院。
- (慈眼院 (滋賀県日野町)) - 滋賀県日野町にある曹洞宗寺院。日野觀音霊場第10番。
- 西方寺慈眼院 - 岡山県瀬戸内市所在の寺院。
- (慈眼院 (倉敷市)) - 岡山県倉敷市にある真言宗寺院。(連島西国三十三箇所)18番札所。
- 慈眼院 (那覇市) - 沖縄県那覇市にある臨済宗妙心寺派の寺院。通称・首里観音堂。
人物
- 慈眼院 - 信濃飯田藩主の堀親長の母、(勅使河原直信)の妹。